{"id":1203,"date":"2020-04-24T16:37:01","date_gmt":"2020-04-24T16:37:01","guid":{"rendered":"http:\/\/randomedicale.com\/?p=1203"},"modified":"2020-04-24T16:37:01","modified_gmt":"2020-04-24T16:37:01","slug":"tests-et-covid-19-les-tests-pcr-sont-ils-fiables-lecture-critique-darticle","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/randomedicale.com\/blog\/2020\/04\/24\/tests-et-covid-19-les-tests-pcr-sont-ils-fiables-lecture-critique-darticle\/","title":{"rendered":"Tests et Covid 19 : Les tests PCR sont-ils fiables? Lecture Critique d&rsquo;article"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-1211\" src=\"https:\/\/randoecni.wordpress.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/capture-de28099ecc81cran-2020-04-24-acc80-18.06.12.png\" alt=\"Capture d\u2019e\u0301cran 2020-04-24 a\u0300 18.06.12\" width=\"262\" height=\"354\" \/><\/p>\n<p>Le directeur de l&rsquo;organisation mondiale de la sant\u00e9 appelle depuis la mi-f\u00e9vrier les pays du monde entier \u00e0 tester les patients afin de d\u00e9tecter les cas de Covid 19. Cependant, quelle est la fiabilit\u00e9 de ces tests ? Sont-ils vraiment efficaces pour d\u00e9tecter les personnes atteintes par le virus ?<\/p>\n<p>En effet, jusque l\u00e0, le test disponible permet de d\u00e9tecter la pr\u00e9sence du virus dans les voies respiratoires d&rsquo;un individu par m\u00e9thode PCR. La positivit\u00e9 du test d\u00e9pend de la quantit\u00e9 de virus pr\u00e9sente dans les voies respiratoires d&rsquo;un individu. Cette quantit\u00e9 d\u00e9pend du temps \u00e9coul\u00e9 depuis l&rsquo;apparition des sympt\u00f4mes et de la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de la maladie.<\/p>\n<p>Les \u00e9tudes \u00e9valuant la performance de ces tests sont d&rsquo;une qualit\u00e9 m\u00e9thodologique faible. Protocoles diff\u00e9rents pour r\u00e9aliser les tests selon les centres, test gold standard mal d\u00e9fini, nombre de patients test\u00e9s faible&#8230; N\u00e9anmoins, l&rsquo;agr\u00e9gation des donn\u00e9es issus de ces \u00e9tudes permet d&rsquo;avoir une estimation de la sensibilit\u00e9 du test (probabilit\u00e9 que le test soit positif chez une personne effectivement atteinte par le virus) qui se situe autour de 70% (IC : 56 &#8211; 82) et de la sp\u00e9cificit\u00e9 (probabilit\u00e9 que le test soit n\u00e9gatif chez une personne qui n&rsquo;est pas atteinte par le virus) qui est proche de 100%.<\/p>\n<p>Rappelons-le, l&rsquo;enjeu du test pour contr\u00f4ler la pand\u00e9mie est double : d\u00e9tecter les cas positifs de mani\u00e8re large pour les isoler tout en \u00e9tant certain que les individus n\u00e9gatifs ne soient pas porteurs du virus. En d&rsquo;autres termes, la valeur pr\u00e9dictive positive et n\u00e9gative du test sont-elles suffisantes ?<\/p>\n<p>Pour bien comprendre ces notions je vous invite \u00e0 consulter un article paru sur le blog de Rapha\u00ebl Groscot (doctorant \u00e0 l&rsquo;universit\u00e9 Paris Dauphine) : <a href=\"https:\/\/www.groscot.fr\/fiabilite-des-tests-de-depistage-covid19\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/www.groscot.fr\/fiabilite-des-tests-de-depistage-covid19 <\/a><\/p>\n<div id=\"attachment_1208\" style=\"width: 1070px\" class=\"wp-caption aligncenter\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-1208\" class=\"alignnone size-full wp-image-1208\" src=\"https:\/\/randoecni.wordpress.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/capture-de28099ecc81cran-2020-04-24-acc80-17.36.34.png\" alt=\"Capture d\u2019e\u0301cran 2020-04-24 a\u0300 17.36.34\" width=\"1060\" height=\"620\" \/><p id=\"caption-attachment-1208\" class=\"wp-caption-text\"><a href=\"https:\/\/www.groscot.fr\/fiabilite-des-tests-de-depistage-covid19\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/www.groscot.fr\/fiabilite-des-tests-de-depistage-covid19<\/a><\/p><\/div>\n<p>Pour contenir l&rsquo;\u00e9pid\u00e9mie de Covid 19, le test PCR a-t-il une valeur pr\u00e9dictive positive et n\u00e9gative suffisamment importante pour diff\u00e9rencier les individus malades des sains ?<\/p>\n<p>Outre la variabilit\u00e9 probable de la sensibilit\u00e9 et sp\u00e9cificit\u00e9 du test PCR selon le centre qui le r\u00e9alise (variabilit\u00e9 interobservateurs) ou le soignant qui le pratique (variabilit\u00e9 intraobservateur), <strong>la pr\u00e9valence de la maladie dans la population a une influence forte sur les conclusions que l&rsquo;on peut tirer des r\u00e9sultats de ces tests.<\/strong> Ainsi, la valeur pr\u00e9dictive positive et n\u00e9gative varient en fonction de la pr\u00e9valence de la maladie dans la population test\u00e9e.<\/p>\n<p>Si la pr\u00e9valence de la maladie est faible dans la population que l&rsquo;on teste (1% des patients de la population que l&rsquo;on teste sont effectivement atteints par le virus) une sp\u00e9cificit\u00e9 de 99% et une sensibilit\u00e9 autour de 70% (fiabilit\u00e9 des tests Covid 19 actuels) correspondent \u00e0 une valeur pr\u00e9dictive positive de 100% et une valeur pr\u00e9dictive n\u00e9gative de 98%.<strong> Le test est donc tr\u00e8s fiable. <\/strong><\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-1210 alignright\" src=\"https:\/\/randoecni.wordpress.com\/wp-content\/uploads\/2020\/04\/capture-de28099ecc81cran-2020-04-24-acc80-18.00.09.png\" alt=\"Capture d\u2019e\u0301cran 2020-04-24 a\u0300 18.00.09\" width=\"309\" height=\"123\" \/><\/p>\n<p>Cependant si la pr\u00e9valence de la maladie augmente dans la population (patients issus d&rsquo;un foyer de contamination forte par le virus o\u00f9 <span style=\"color:var(--color-text);\">45% des personnes pr\u00e9sentent la maladie) ; pour les m\u00eames valeurs de sensibilit\u00e9 et de sp\u00e9cificit\u00e9 <strong>la valeur pr\u00e9dictive n\u00e9gative du test n&rsquo;est plus que de 80%. <\/strong><\/span><br \/>\n<span style=\"color:var(--color-text);\">Pour vous en convaincre je vous invite fortement \u00e0 utiliser le module propos\u00e9 dans la deuxi\u00e8me partie de l&rsquo;article de Rapha\u00ebl Groscot : <\/span><a href=\"https:\/\/www.groscot.fr\/fiabilite-des-tests-de-depistage-covid19\">https:\/\/www.groscot.fr\/fiabilite-des-tests-de-depistage-covid19<\/a><\/p>\n<p>Ainsi, on comprend pourquoi le test PCR actuel n&rsquo;est pas assez fiable pour \u00eatre utilis\u00e9 dans une population o\u00f9 la pr\u00e9valence de l&rsquo;infection par Covid 19 est \u00e9lev\u00e9e. (Par exemple, les personnes issues d&rsquo;une zone o\u00f9 le virus circule activement comme \u00e0 Mulhouse ou dans l&rsquo;Oise).<\/p>\n<p>Si notre infrastructure ne permet pas aujourd&rsquo;hui de tester tout le monde, on peut s&rsquo;interroger sur la pertinence de r\u00e9aliser des tests sur des patients pr\u00e9sentant des sympt\u00f4mes typiques du coronavirus issus d&rsquo;une ville o\u00f9 le virus circule activement. <strong>Tester des personnes asymptomatiques ou pr\u00e9sentant une symptomatologie atypique dans des r\u00e9gions o\u00f9 le virus circule peu <\/strong>est loin d&rsquo;\u00eatre absurde.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Le directeur de l&rsquo;organisation mondiale de la sant\u00e9 appelle depuis la mi-f\u00e9vrier les pays du monde entier \u00e0 tester les patients afin de d\u00e9tecter les cas de Covid 19. Cependant, quelle est la fiabilit\u00e9 de ces tests ? 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